| Version | 1.01 |
|---|---|
| Utgivare | Paul A. Wilson |
| Utgivningsdatum | 25 aug. 2008 |
| Datum tillagt | 11 aug. 2004 |
| Os krav | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Krav | Mac OS X 10.3 |
| Totalt antal nedladdningar | 29 |
| Pris | Free |
Beskrivning
Kommandoradsverktyg för att jämföra kommaavgränsade datafiler med hjälp av relativa skillnader för att bestämma de mest lika konformationerna. Compsort jämför datafilerna med relativ skillnad, beräknar ett likhetspoäng, sorterar poängen i stigande ordning (lägre värden representerar större likhet), sparar X antal låga poäng.
Datafilerna som produceras av användaren måste vara kommaseparerade textfiler. Varje fil representerar en unik molekyl. Varje rad i en fil representerar en unik konformation av molekylen. Den första kolumnen i datafilen måste vara en etikett som är unik för den konformation som representeras av raden. Resten av kolumnerna är numeriska deskriptorer, till exempel avståndsmått.
Raderna jämförs kombinatoriskt mellan filer. Etiketterna i jämförelse är sammanlänkade och sparas med poängen för uppsättningen rader. Detta ger ett sätt att identifiera de konformationer som gav ett givet likhetspoäng.
Framtida arbete inkluderar:
lägga till GUI-gränssnitt
publicera papper om min 3D farmakoformodelleringsalgoritm
En parallell version med MPI
