pppBenchmark

Beskrivning

pppBenchmark tillhandahåller en storskalig benchmarkingstudie av 17 state-of-the-art OPP. En mångfacetterad utvärderingsstrategi föreslås som kan användas som en guldstandard för promotorförutsägelseutvärdering, vilket gör det möjligt för författare av promotorförutsägelseprogramvara att jämföra sin metod med befintliga metoder på ett korrekt sätt. Denna utvärderingsstrategi används därefter för att jämföra de valda promotorprediktorerna och en djupgående analys av prediktiv prestanda, promotorklassspecificitet, överlappning mellan prediktorer och positionsförspänning av förutsägelserna genomförs.