Ascalaph Designer

Beskrivning

Ascalaph Designer är ett allmänt program för molekylär dynamiska simuleringar. Under en enda grafisk miljö representeras som sin egen implementering av molekylär dynamik samt metoderna för klassisk och kvantmekanik av populära program. Funktionerna inkluderar molekylär grafik: flera fönster, två kameror per modell, CPK, Wire frame, Stick, Ball and Stick och CPK Wire ramstilar, molekylär modellbygge: kristallbyggare, kedjebyggare, ritning med mus, redigering av molekylär geometri, preliminär optimering , kvantoptimering och borttagning av sammanstötningar, molekylär geometrioptimering med konjugerade gradientmetoder, molekylär dynamik: multipel tidsstegsintegration, fjärde ordningens integration, superdatorberäkningar med hjälp av MDynaMix, flexibel SPC-vattenmodell och implicit vattenmodell, och kvantkemi med hjälp av CP2K och PC GAMESS/Firefly: energi, molekylär geometrioptimering och potentiella härledda laddningar.