Pedimap

Beskrivning

Pedimap är ett verktyg för att utforska och visualisera flödet av fenotyper och alleler (observerade eller baserat på Identity-by-Descent-beräkningar) genom stamtavlor. Den har verktyg för manuellt och automatiskt urval av delar av stamtavlan baserat på kriterier som förfäder och/eller avkomma till ett specificerat antal generationer, längs moderns, faderns eller bådas linjer, syskon etc. För varje urval kan flera vyer göras genereras för att visa olika kopplingsgrupper, fenotypiska egenskaper etc. När väl en vy har skapats för ett urval kan den automatiskt återskapas för vilket annat urval som helst. Pedimap kan hantera såväl numeriska som textmässiga fenotypiska poäng, och med polyploider såväl som diploider. Den genetiska informationen kan visas enligt genetiska länkkartor, därav namnet.