POY

Beskrivning

POY är ett fylogenetiskt analysprogram som stöder flera typer av data (t.ex. morfologi, nukleotider, gener och genregioner, kromosomer och hela genom). POY är speciellt genom att det kan utföra verklig inriktning och fylogenisk slutledning, dvs ingångssekvenser behöver inte vara förinställda. Infogningar, borttagningar och omarrangemang kan sedan inkluderas i det totala trädpoängen under Maximum Parsimony, eller i modellen under Maximum Sannolikhet. En mängd olika heuristiska algoritmer har utvecklats för detta ändamål och är implementerade i POY.