ImageSurfer

Beskrivning

ImageSurfer är ett gratis 3D-bildprogram för mikroskopi. Det gör det möjligt för utredare att visualisera och analysera flerkanaliga 3D- och 4D-volymer (time-lapse). ImageSurfer tillhandahåller flera verktyg för bildåterställning inklusive avvecklingsalgoritmer (Wiener-filter, begränsad iterativ och maximal sannolikhet) för att avlägsna suddighet som introduceras av bildsystemet. För visualisering erbjuder ImageSurfer flera volym- och ytrenderingstekniker. Programvaran har också ett innovativt färgat isosurface-läge som ger en kvalitativ visning av korrespondensen mellan två kanaler.

En "slice extractor" gör det möjligt för användaren att undersöka ett tvärsnitt av volymen som tas i vilken riktning som helst. Den fångade skivan kan visualiseras som en traditionell 2D-bild eller som en 3D-reliefrepresentation där bildintensiteten är kodad som höjd. För att ytterligare undersöka rumslig överlappning mellan strukturer kan utredaren använda data från en annan kanal för att färga 3D-reliefrepresentationen. För kvantifiering kan sedan signalintensitetsvärden samplas inom fångade skivor längs en användardefinierad spline. Förutom att ta ögonblicksbilder av 3D-representationer och generera filmer kan 3D-modeller också exporteras som OBJ- eller VRML-filer (virtual reality modelleringsspråk); VRML-filer kan visas i webbläsare med ett gratis plugin-program. Båda filtyperna kan importeras till populära 3D-renderingsprogram för vidare bearbetning och till Acrobat 3D för att producera dokument som kan ses interaktivt med Adobe Reader 8.